Федеральное бюджетное учреждение «Научно-технический центр «Энергобезопасность», учреждено Министерством топлива и энергетики Российской Федерации приказом от 15 июля 1997 г. № 203, в соответствии с которым именовалось Государственное некоммерческое учреждение «Научно-технический центр надзора за плотинами и энергосооружениями Минтопэнерго России» (НТЦ Энергонадзора Минтопэнерго России). В связи с преобразованием Министерства топлива и энергетики Российской Федерации в Министерство энергетики Российской Федерации Распоряжением Минэнерго России от 5 мая 2003 г. № 78-р Учреждение было переименовано в Федеральное государственное учреждение «Научно-технический центр надзора за плотинами и энергосооружениями» Министерства энергетики Российской федерации (НТЦ Энергонадзора). 29 декабря 2004 г. распоряжением Правительства Российской Федерации № 1725-р НТЦ Энергонадзора передано в ведение Федеральной службы по экологическому, технологическому и атомному надзору. Приказом Ростехнадзора от 11 марта 2005 г. № 143 Учреждение переименовано в Федеральное государственное учреждение «Научно-технический центр «Безопасность гидротехнических сооружений» (ФГУ «НТЦ Гидротехбезопасность»), а в соответствии с приказом Ростехнадзора от 8 августа 2006 г. № 748 переименовано в Федеральное государственное учреждение «Научно-технический центр «Энергобезопасность» (ФГУ «НТЦ Энергобезопасность»). В связи с совершенствованием правового положения государственных (муниципальных) учреждений и в целях приведения типа Учреждения в соответствие с законодательством Российской Федерации Приказом Ростехнадзора от 28.10.2010 № 1021 ФГУ «НТЦ Энергобезопасность» отнесено к федеральным бюджетным учреждениям, в связи с чем Приказом Ростехнадзора от 20.01.2011 № 21 утвержден Устав Учреждения, в соответствии с которым оно именуется как Федеральное бюджетное учреждение «Научно-технический центр «Энергобезопасность»